衛生殺蟲劑作為防治這些衛生害蟲的產品，因其選購時需注意是否具有農藥三證，導致很多居民以為衛生殺蟲劑就是農藥。其實不然，那么衛生殺蟲劑與一般農藥究竟有哪些區別呢？

首先兩種殺蟲劑的使用場所是不同的。衛生殺蟲劑主要用在人類居住、生活和工作的場所，因此對衛生殺蟲劑的安全性有很高的要求;一般農藥則用在農、林、牧上面，對安全性的要求沒有衛生殺蟲劑那么高。衛生殺蟲劑在市面上售賣需要具有相關證明，也就是農藥三證。由國家農業部門頒發的證書。

衛生殺蟲劑與農藥原藥在純度、毒性、殘留和對物體安全性上都有區別。衛生殺蟲劑的原藥要求純度高、中等毒性或低毒，無三致作用，即致畸、致癌和致突變，低殘留。而農藥原藥卻沒有這么高的技術上的要求。

很多殺蟲劑可以農用，也可以衛生用，但它們的純度不同。殺蟲劑對人和環境的影響，很多是由原藥中所帶雜質造成的，對于原藥其毒性研究很多，毒性明確。但雜質種類不確定、種類繁多，對人和環境的影響也復雜。一般要求純度在95%以上。

配制殺蟲劑制劑需要加入很多助劑，助劑的毒性與安全性也非常重要。例如，農藥乳油中，大量使用二甲苯苯系化學品做溶劑，毒性很大。同時助劑的純度也低，其中另外混有種類不詳、性質不清的工業雜質，進一步增加了制劑的毒性及其不確定性。配制衛生殺蟲劑的助劑同樣應該純度高、無毒，盡量減少使用。